Zur Pflege des disziplinären und interdisziplinären Dialogs gliedert sich die Akademie in fünf Klassen. Die Klassen regeln ihre Angelegenheiten selbst. Sie werden von Sekretaren geleitet. Die Klassen treten mehrmals im Jahr, auch zu gemeinsamen Sitzungen, zusammen. Sie machen Vorschläge für die Wahl neuer Mitglieder, für die Einsetzung und Beendigung von Arbeitsgruppen und Kommissionen.
Sekretar: Markus Stommel
Stellvertretender Sekretar: Olaf Dössel